两种掌机游戏区别较大，NDS和3DS游戏制作偏向是不同的。
首先是任天堂两代不同的掌机，3DS性能远比NDS强大，性能对比NDS＜PSP＜3DS＜NEW3DS＜PSV。
超级任天堂限定版NEW3DSLL
其次NDS游戏更偏向下屏触摸利用，上屏像是辅助屏，而3DS更注重上屏裸眼立体画面利用，下屏更像是辅助屏。
举例：比如NDS有众多虐待下屏的游戏，比如应援团，节拍特工，为你而死，为你而生等虐待下屏游戏在3DS上都没有了，这些游戏需要快速点击下屏进行游戏，可以玩得大汗淋漓。NDS众多过关冒险游戏也大规模利用下屏游戏，比如红侠乔伊，侠盗飞车之血战唐人街，生化危机DS等下屏利用至关重要，还有太多利用下屏游戏就不多说了。3DS注重对上屏裸眼立体显示利用，比如马里奥3D大陆，启示录1等，弱化了对下屏利用，合金装备3D，分裂细胞3D，逆转裁判裸眼立体画面冲击力也是NDS不能做到的。
最后总结起来，NDS重视下屏，触摸有趣，3DS重视上屏，视觉冲击好。NDS有趣的游戏更多，玩法更有意思，至今不落后，3DS裸眼立体画面利用出色，但是游戏数量锐减太多，NDS和3DS游戏互相不冲突，两种掌机游戏交叉玩，乐趣更多。3DS完全兼容NDS游戏，并且3DS和NDS独特硬件性能，游戏相比Switch游戏也不冲突。